Protein–RNA interactions for Protein: Q32NZ6

Tmc5, Transmembrane channel-like protein 5, mousemouse

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Length 967 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc5Q32NZ6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmc5Q32NZ6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc5Q32NZ6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms