Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne9Q1RLL3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms