Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Perm1Q149B8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Perm1Q149B8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Perm1Q149B8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Perm1Q149B8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Perm1Q149B8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Perm1Q149B8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Perm1Q149B8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms