Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms