Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms