Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms