Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms