Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms