Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms