Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms