Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms