Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms