Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CkbQ04447 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CkbQ04447 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CkbQ04447 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms