Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnd1Q03719 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms