Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Msx2Q03358 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx2Q03358 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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