Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna1sQ02789 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms