Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms