Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms