Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnb1Q02248 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms