Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms