Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms