Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp10Q000W5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms