Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt86P97861 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms