Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IhhP97812 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IhhP97812 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IhhP97812 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IhhP97812 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IhhP97812 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms