Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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