Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms