Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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