Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms