Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms