Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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