Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms