Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch1P62046 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch1P62046 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms