Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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