Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vbp1P61759 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Vbp1P61759 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vbp1P61759 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vbp1P61759 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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