Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Taf13P61216 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Taf13P61216 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Taf13P61216 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Taf13P61216 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Taf13P61216 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Taf13P61216 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf13P61216 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf13P61216 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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