Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp1P61022 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chp1P61022 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms