Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ActbP60710 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms