Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms