Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcstnP57716 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms