Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms