Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcanP55066 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcanP55066 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcanP55066 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms