Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PltpP55065 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PltpP55065 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PltpP55065 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PltpP55065 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PltpP55065 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PltpP55065 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PltpP55065 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PltpP55065 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PltpP55065 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms