Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PctpP53808 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PctpP53808 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PctpP53808 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PctpP53808 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms