Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TspoP50637 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TspoP50637 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms