Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cav1P49817 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cav1P49817 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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