Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms