Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VdrP48281 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VdrP48281 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VdrP48281 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VdrP48281 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms