Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epb41P48193 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms