Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo1bP46735 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo1bP46735 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms