Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf1P46099 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms